DMZ 생태연구소는 DMZ(민간인 통제구역 포함) 일원의 생태환경 조사 및 연구를 비롯하여, 생태환경 관련 정책의 연구 사업 등을 하는 곳이다. 특히 다양한 생명들이 살아가는 DMZ 생태환경에 대한 지속적 교육 사업의 일원으로 일부 지역에 대한 탐사 활동을 하는 생태학교를 매월 운영하고 있다.